per l'overclock su kali non so rispondere non avendolo installato mai sull'rpi ma solo sul mio portatile samsung.
per la ventola intanto ne esistono oltre che a 12 volt anche ad altri voltaggi, tra i più comuni 5 e 24, per esempio la mia era a 5 volt collegata all'alimentatore di un vecchio nintendo ds lite che se mi ricordo bene eroga 4,8 volt, non l'avevo collegata all'rpi perche l'alimentatore dell'rpi era da 1,2 ampere e non volevo ne rischiare di superare quella soglia ne di avvicinarmici troppo.
inoltre esistono svariati metodi per controllare carichi a voltaggi maggiore con tensioni più basse ma ovviamente ti servirebbe anche un alimentatore a 12 o 24 volt oltre che della circuiteria esterna e di conseguenza se non ti interessa del rumore ti consiglio di lasciarla direttamente collegata al suo alimentatore esterno indipendentemente che sia a 5, 12 o 24 volt oppure se hai un alimentatore per l'rpi migliore di quello che avevo e usi una ventola a 5 volt direttamente all'rpi
inoltre molte ventole a 12 volt alimentate a 5 volt girano molto piano ma girano, io te lo sconsiglio perché alcune hanno problemi a partire
mentre se vuoi regolarne la velocità penso che il metodo piu facile sia trovare una ventola pwm a 5 volt, gestirla tramite gpio non sarà difficile