Io so che con alcune custom rom (cioè dei sistemi operativi che installi te) non va in quanto YAP rileva la modifica del software. In termini tecnici, se il sistema operativo utilizza SeLinux di tipo "Permessive" non va bene, deve utilizzare quello di tipo "Enforcing". Potete cercare qualche guida online per capire il tipo di SeLinux che avete nella custom rom. Se invece non avete cambiato sistema operativo ma avete fatto solo il root, non so come aiutarvi.