Il software Tor permette a gli altri programmi di redirigere il traffico proprio tramite TCP su localhost, implementando il protocollo SOCKS. Quindi si, qualunque richiesta passa da questo "proxy" locale in realtà usa la "rete tor". Funziona così anche il Tor Browser, ma solitamente se vuoi usare proxychains + tor è per qualche altro tipo di programma come uno script, se lo usi con un browser classico come Chrome o Firefox base ti esponi a rischio di fingerprinting, saresti uno dei pochi utenti tor ad avere user agent diverso eccetera, rendendoti praticamente unico.