se hai installato ubuntu sotto legacy invece di uefi, il tuo usb non vede una partizione valida per copiare i files, perchè windows non vede la partizione di ubuntu.
Non è proprio esatto, a me è successo qualcosa di simile.
Ci sono due modalità di funzionamento della scheda madre: Legacy e UEFI.
La prima utilizza il bios per gestire l'avvio delle partizioni ( puoi scegliere solo quella di avvio e le altre restano invisibili, utilizzando MBR ).
La seconda crea una partizione in cui è possibile gestire singolarmente le impostazioni di avvio di ogni singola partizione, come per prima, devi sempre selezionare la partizione principale per l'avvio del sistema operativo.
Il problema nasce quando non utilizzi lo stesso metodo di gestione delle partizioni sul disco e sulla chiavetta.
Ti consiglio di fare le cose sempre con la modalità UEFI, quindi devi stare attento al modo in cui formatti la chiavetta o avvii il sistema.
L'impostazione si trova facilmente nelle impostazioni del BIOS.
Rispondendo alla citazione: non è un problema di sistemi operativi, questo può rompere le scatole quando devi andare a creare la partizione dal disco di windows e hai un file system non supportato ( come ext3 o ext4 che windows non riesce a leggere ).
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EDIT: potrebbe anche essere un problema molto più banale, hai collegato la chiavetta ad un porta non abilitata durante l'avvio del sistema ( per esempio le USB 3.0 possono dare questo problema, le 2.0 funzionano di sicuro )
vedrò di installare windows in dual boot magari